Bir köle olan ve daha sonra askeri akademinin en iyi öğrencisi haline gelen Teito Klein, elle kontrol edilen Zaiphon adlı bir güce sahiptir. Mezuniyet sınavının ilk yarısında başarılı olur ancak ertesi gün tesadüfen keşfettiği babasının katiline saldırınca Barsburg İmparatorluğu güçleri Teito’yu esir alır.

Ellerinden kurtulan ama artık kaçak bir suçlu olan Teito, bir grup papaz tarafından bulunup uzaktaki bir kilisenin revirine kaldırılır. 7. bölgede yer alan bu kilise, imparatorluk askerlerinin yetki alanının dışında kalan kutsal bir alandadır. Burada Yedi Hayalet (Seven Ghosts) efsanesini öğrenmesinin yanında Teito kendisi, kilise ve İmparatorluk hakkında daha birçok gizemi keşfeder: Yıkılan Raggs krallığı ve Tanrı’nın gizemli taşı Mikhael’in Gözü (The Eye of Mikhael) ile bağlantısı olması ihtimali, O’nu imparatorluğun her zamankinden de büyük bir hedefi haline getirmektedir.

Şansına sığındığı kilise, efsanedeki Yedi Hayalet’in koruması altındadır. Bu “hayaletler” tam olarak nedir? Teito geçmişini öğrenebilecek ve intikamını almayı başarabilecek midir?