Bir kez daha, Kaitou Kid'in aklında bir hedef var: Avrupa'nın Ingram Prensliği Kraliçe Selizabeth'e ait en büyük topaz olan Kristal Anne. Kraliçe Tokyo'dan Osaka'ya bir trene sıkışmışken bu mücevheri çalmayı planlıyor. nnBununla birlikte, Kraliçe gemiyi trende bir yerde saklamış olduğundan, çocuğun yetenekleri teste tabi tutulur. Tren yolcuları arasında yer alan Conan Edogawa, hayalet hırsızdan bir saldırıdan şüpheleniyor ve kendi başına soruşturmaya başlarken, Müfettiş Ginzou Nakamori mücevher soyguncusuna karşı yeni bir çatışmaya hazır.